Mam przypadek - może nie taki sam, ale podobny i myślę ze możesz go wykorzystać. Mianowicie udziały dwóch wspólników w spółce są 60/40. A zatem wszystkie koszty i przychody dotyczące tej działalności dzielone są tą proporcją. Pojawia się jednak składka na Fundusz Pracy, i ta nie może być w ten sam sposób dzielona. W związku z tym nie ujmuję jej w miesięcznych kosztach, wpisuje ją dopiero do PIT-36 (a dokładniej w części B załącznika PIT-B) u każdego wspólnika w tej samej wysokości. Do Urzędu Skarbowego wraz z deklaracją załączam informację skąd bierze się kwota kosztów w części B i dlaczego ujęta jest oddzielnie i koniec.
Robię tak od 5 lat, nigdy nie było problemu. Zresztą oni wiedzą, ze są takie przypadki i to całkiem często.
Jest jeszcze inne wyjście, ale wymaga więcej kombinacji, a im mniej pracy a efekt ten sam - tym lepiej