Co to znaczy - "koszt jest bez VAT" ??
Kosztem jest faktura za zakupiony towar ( tą wprowadzam do Subiekta i importuję do Rachmistrza) oraz każda faktura za zakup czegokolwiek na potrzeby firmy ( paliwo, papier,prąd) - te księguję bezpośrednio w Rachmistrzu. I każdy z tych dokumentów daje Ci możliwość odliczenia VAT - co to znaczy "koszt jest bez VAT"

Takim kosztem jest faktura za zakup od samego siebie czegokolwiek - też możesz na jej podstawie odliczyć VAT.

No to dla mnie jest to rewelacja - zamiast jednego prostego dokumentu RW, wystawiam najpierw fakturę sprzedaży (na siebie), którą następnie wpisuję jako fakturę zakupu - transkcja VAT z samym sobą.
Dwa dokumenty zamiast jednego oraz dodatkowe zapisy w ewidencjach VAT. I ewentuane tłumaczenia w razie kontroli, co to za transakcja z samym sobą.
Jest taki przepis, że biorąc na własne potrzeby prywatne, trzeba było wystawić fakturę wewnętrzna z VAT i ją rozliczyć.
Ale to trochę inna sytuacja, A Ty przenosisz to na grunt potrzeb własnych firmy.
Czy jak ktoś ma produkcję, to kupione materiały sprzedaje na produkcję fakturą VAT, a kolei gotowe produkty kupuje z produkcji też na fakturę VAT?
Czy wiesz co to są puste faktury? Bo to, co proponujesz jest wystawianiem pustych faktur, bo nie obrazują rzeczywistej transkacji. A wystawianie pustych faktur jest niedozwolone.

Uzupełniam odpowiedź na piewrwsze pytanie - co to jest koszt bez VAT.
To jest zużycie zakupionych towarów/materiałów na potrzeby własne jednostki. Księgujemy je w koszty prowadzonej działaności w rzeczywistej cenie nabycia czyli właśnie poniesionego na ich zakup kosztu. Oczywiście jest to transakcja wewnętrzna bez VAT.

Kluczowe słowo to "Przeksięgować"

Wpisujesz to RW z minusem w kolumnie "zakup towarów handlowych" I z plusem w kolumnie "pozostałe".

W sumie koszty pozostają niezmienione, zmienia się tylko ich umiejscowienie.

A co ma do tego faktura zakupu?
Cały czas dyskusja dotyczy RW.

Nie wystawiaj żadnych faktur, a tym bardziej VAT. Jak go będziesz miał do zwrotu, to poczekasz 60 dni na te pieniądze.. Z tym, ze to jest najmniej istotne.
Dokument RW na potrzeby własne/wewnętrzne firmy wystawiony w Subiekcie można normalnie zaksięgować w KPIR (tyle, że ręcznie, bo nie pamiętam czy tam jest jakiś wzorzec) wpisując kwotę pobranych materiałów z minusem w kolumnie 10 (korekta) i z plusem w kolumnie 13.
Efektem tej operacji jest wartość "zero", bo tylko zmieniasz kwalifikację wydatku, a zmiana przeznaczenia towaru handlowego nie powoduje konieczności korekty VAT naliczonego przy ich zakupie.

Zastanawiam się, czy nie najprościej byłoby po prostu zrobić sprzedaż na paragon z minimalną marżą - dużo mniej zabawy.

Możesz rozpisać to na paragon, ale wówczas nie odliczysz VAT i dochodowego.
Dla przykładu na 19% podatku liniowym:
Kupisz za 1000 zł -> sprzedaż za 1001 -> do zapłaty dochód i VAT od 1 zł (na minusie 0,42 zł)
Kupisz za 1000 zł i wrzucisz w koszty -> do odliczenia 23 zł VAT i podatek (na plusie 420 zł)

Możesz rozpisać to na paragon, ale wówczas nie odliczysz VAT i dochodowego.
Dla przykładu na 19% podatku liniowym:
Kupisz za 1000 zł -> sprzedaż za 1001 -> do zapłaty dochód i VAT od 1 zł (na minusie 0,42 zł)
Kupisz za 1000 zł i wrzucisz w koszty -> do odliczenia 23 zł VAT i podatek (na plusie 420 zł)

Faktycznie, przy wyższych kwotach to już robi różnicę (rozumiem, że 230 zł VAT, tylko zero uciekło:))

Jeszcze tak dla pewności - RW jak i księgowanie kosztu w cenie netto?