Będzie działał Czerwony Dodatek jeśli mam konta w Inteligo a oni nie obsługują tego formatu MT-940 tylko np. CSV , EXCEL.

Inteligo w ogóle nie oferuje wyciągów bankowych w formie elektronicznej, dostępna jest historia transakcji, z której można korzystać... Co do programu to w standardzie nie są obsługiwane żadne formaty z historią transakcji, ale jest możliwość dodania do programu parserów obsługujących nowe formaty. Nie dawno realizowałem parser dla historii transkacji z PKO BP w oparciu o format XML, format Inteligo jest podobny.

Jest jakiś automatyczny sposób aby co miesiąc sprawdzać czy wszystkie pobrania kurierskie, pocztowe, tpay doszły na konto i sprawdzić w Subiekcie zamówienia do nich ?

Tak, należy prowadzić rozrachunki z pośrednikami płatności... Przy większej ilości transkacji niezastąpioną pomocą będzie rozwiązanie dodatkowe do automatycznego rozliczania rozrachunków na podstawie specyfikacji łącznej wpłaty od pośrednika płatności, oczywiście w programie należy mieć powiązanie między wpłatą na należnością poprzez numer listu przewozowego lub numer transakcji. Posiadam gotowe rozwiązanie, które obsługuje wiele formatów, w przypadku zainteresowania wiesz gdzie się odezwać.