Twoje pytanie sprowadza się do tego jak wyciągnąć z programu informację, której się do niego nie wprowadziło

No, niestety tak się nie da.
Jeśli nie chcesz wprowadzać do Subiekta f-r zakupu z pozycjami magazynowymi to wpisuj je jako zakup usług (całą fakturę w jednej pozycji, ew. w rozbiciu na stawki).
Wpiszesz szybko i będą rozrachunki. Jeśli masz Rachmistrza na tej samej bazie to będzie można zaimportować dane do KPiR bez ponownego wpisywania.