Może tego nie wiesz, ale schematy importu działają przede wszystkim wg Kategorii dokumentu. A dopiero na drugim miejscu jest rodzaj dokumentu czy dokonywane operacje.
Jeśli zastosujesz kategorię Sprzedaż dla dokumentów sprzedaży, to możesz w ramach tej kategorii wybierać typ dokumentu, rodzaj transakcji VAT, magazyn.
W ślad za tym ustawiasz Rejestr księgowy i Ewidencję VAT.
Ale nie ma automatu, który ustawiał by np. Ewidencję VAT w zależności od typu transakcji VAT. To musisz ustawić w danym schemacie ręcznie.