Prowadzimy sprzedaż hurtową ale niestety przekroczyliśmy pewne progi jeśli chodzi o sprzedaż detaliczną i musieliśmy kupić drukarkę fiskalną. Pan przyjechał podłączył do programu i teraz nie wiemy pewnych rzeczy a mamy klienta, który chce wziąć towar na przelew.

Nie, wystawienie dokumentu nie ma nic wspólnego z jego fiskalizacją, a wygląda na to, że po takim czasie korzystania z programu nie potraficie wystawiać dokumentów i określać poprawnych form płatności...

Wystawiamy paragon zwykły i wybieramy opcję zapłacono przelewem

Zapłacono przelewem analogicznie do zapłacono gotówką oznacza, że płatność następuje w momencie wystawienia dokumentu, a tak raczej nie było, skoro tak nie było to dlaczego jest wybierana forma płatności niezgodna z rzeczywistością ? Ogólnie zalecam w ogóle wyłączyć tę formą płatności przy pełnej księgowości, gdyż bardziej przeszkadza i powoduje problemy niż pomaga.

następnie wystawiamy fakturę detaliczną (ponieważ klient tak sobie życzy)

Sposób wystawienia dokumentu to wasza decyzja, a nie życzenie klienta, można wystawić paragon i fakturę do niego, ale bez problemu można od razu wystawić fakturę i ją zafiskalizować.

i tu pojawia się problem bo tego kontrahenta nigdzie nie widać i jak zapłaci (pobranie kurier) to jak mam to skojarzyć z rozrachunkiem, którego nie mam

I okazuje się, że nie chodzi o formę płatności zapłacono przelewem, ani też o kredyt kupiecki tylko o pobranie, czyli o formę płatności z cesją rozrachunku (na kuriera), a do tego wykorzystuje się w programach Insertu płatności kartą i kredyt ratalny (polecam płatność kartą) - po zdefiniowaniu i wybraniu takiej formy płatności będziesz miała rozrachunek na kurierze i wszystko obsłużysz schematem importu w księgowości.

No po tak długim czasie pracy na programie nie potrafimy nic określić ponieważ my prowadziłyśmy do tej pory księgowość ręcznie a program był używany tylko do potrzeb rozrachunkowych a teraz próbujemy coś robić więc jakby Pan był tak uprzejmy i powiedział jeszcze jedną rzecz jak wystawimy paragon imienny i do niego fakturę to co mamy zaimortować do rewizora żeby się nie zdublowało na rozrachunkach paragon czy fakturę?

To zależyjaki model księgowania przyjęliście.
Jeśli księgujecie raporty fiskalne ( a nie poszczególne paragony), to księgując później fakturę macie wpis zduplikowany.
Jesli księgujecie paragony, to macie wybór to lub to. Do tej pory w takim przypadku nie księgowało się FSd (bo łatwiej).
Od chwili podlegania pod jpk muszą być księgowane wszystkie faktury, więc trzeba walczyć z paragonami/raportami i ew. korektami do nich.

Jeszcze nie przyjęłyśmy żadnych metod. Na razie chciałam się tylko dowiedzieć jak to zrobić, żeby było dobrze i najlepiej byłoby wystawić fakturę a następnie zaznaczyć kwadracik rejestruj dokument na drukarce fiskalnej ale po zrobieniu tego okazało się, że paragon różni się od faktury i nie wiem czy to kwestia ustawień w programie czy po prostu tak jest.
Wtedy zaimportujemy sobie fakturę i sprawa prosta gdyby nie te różnice.

Takie faktury trzeba wystawiać od brutto, a standardowo faktura jest od netto. Urządzenia fiskalne zawsze liczą od brutto, stąd róznice.
Paragony sa liczone od brutto, ale ten parametr ustawia się w parametrach dokumentów jako domyslny. Można go zmieniać przy wystawianiu dokumentu, ale to dwa kliknięcia więcej i trzeba pamiętać. Można też ustawić paramet przeliczania automatycznego przy fiskalizacji faktury, tylko wtedy najpierw trzeba zafiskalizować, a dopieró później wydrukować na zwykłej drukarce.